一、综合管理部（应急办）
二、党建工作部（纪检监察室）
三、人事管理部（工会）
四、财务管理部
五、业务（发展）管理部
六、质量管理部（药品化妆品抽检监测秘书处）
七、食品药品抽样管理部
八、教育培训部
九、信息统计部
十、设备和科研管理部
十一、化学药品检验检测所
（一）化学药品检验检测一部
（二）化学药品检验检测二部
十二、中药检验检测部
十三、化妆品检验检测部
十四、药品包装材料及辅料检验检测部
十五、生物制品检验检测部
十六、微生物检验检测部
十七、安全评价研究中心
十八、食品药品技术研究中心
（一）食品药品理化检验检测部
（二）食品药品微生物检测部
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